PCR實驗室可以通過DNA基因追蹤系統來掌握患者體內的病毒含量,具有較大擴增能力與極高的靈敏性,但令人頭痛的問題是容易污染,極其微量的污染即可造成假陽性的產生。那么PCR實驗室的污染類型有哪些?該怎樣預防呢?
一、PCR實驗室的污染類型
1、樣本間交叉污染
標本污染主要有收集標本的容器被污染,或標本放置時,由于密封不嚴溢于容器外,或容器外粘有標本而造成相互間交叉污染。標本核酸模板在提取過程中,由于吸樣槍污染導致標本間污染。有些微生物標本尤其是病毒可隨氣溶膠或形成氣溶膠而擴散,導致彼此間的污染。
2、PCR試劑的污染
主要是由于在PCR試劑配制過程中,由于加樣槍、容器、雙蒸水及其它溶液被PCR核酸模板污染。
3、PCR擴增產物污染
這是PCR反應中最主要最常見的污染問題,因為PCR產物拷貝量大(一般為1013拷貝/mL),遠遠高于PCR檢測數個拷貝的極限,所以極微量的PCR產物污染,就可造成假陽性。
4、實驗室中克隆質粒的污染
在分子生物學實驗室及某些用克隆質粒做陽性對照的檢驗室,這個問題也比較常見。因為克隆質粒在單位容積內含量相當高,另外在純化過程中需用較多的用具及試劑,而且在活細胞內的質粒,由于活細胞的生長繁殖的簡便性及具有很強的生命力,其污染可能性也很大。
二、PCR實驗室的防污染方法
1、嚴格執行各區功能劃分:
試劑儲存和準備區:貯存試劑的制備、試劑的分裝和擴增反應混合液的準備,以及離心管、吸頭等消耗品的貯存和準備。
標本制備區:核酸(RNA、DNA)提取、貯存及其加入至擴增反應管。對于涉及臨床樣本的操作,應符合生物安全二級實驗室防護設備、個人防護和操作規范的要求。
擴增區:cDNA合成、DNA擴增及檢測。
擴增產物分析區:擴增片段的進一步分析測定,如雜交、酶切電泳、變性高效液相分析、測序等。
試劑準備區、樣本制備區和擴增區內的實驗用品,包括移液器等器具應專用,空氣、物品流向依次為:試劑準備區、樣本制備區、擴增區、產物分析區,不可逆行。
2、清潔的實驗用品:
實驗室自配試劑(去離子水、緩沖液等)和所有使用器具在使用之前均應高壓滅菌或紫外殺菌。槍尖、反應管等實驗耗材應一次性使用。
3、正確的實驗操作:
實驗應在超凈工作臺內進行,工作臺內應放置PCR專用的微量離心機、各量程的移液器和其他必須物品。
實驗的過程中選擇最合適尺寸的手套并能及時更換,在進出不同實驗區域或進行模板操作后都應更換實驗服、口罩、帽子及手套,以避免不同實驗區交叉污染。
裝有PCR試劑的反應管在打開之前應先瞬時離心,將管壁及管蓋上的液體離至管底,降低污染手套或加樣器的風險;謹慎開啟反應管,防止管內液體濺出或形成氣溶膠導致污染。
吸加試劑和模板的操作應嚴格按照規范要求進行,遵守“慢吸快打”原則,盡量一次性完成,忌多次抽吸,以避免氣溶膠產生的交叉污染。
PCR試劑建議小量分裝,以減少反復凍融、重復取樣次數;多樣本PCR反應時,先配制反應混合液分裝至反應管中,最后加入樣本核酸,請勿同時開蓋,盡量保證單人單管,實現完全閉管操作。
實驗試劑應與樣品和PCR產物分開保存,不應放于同處。
PCR擴增實驗完成后及時將反應管取出,用一次性手套將產物反應管包裹丟棄,保證管蓋緊閉。
4、規范的實驗設計:
應遵循實驗室內部質量控制的相關規定,實驗中設立陽性對照、陰性對照和空白對照,全程質控實驗過程,驗證PCR反應的可靠性,并協助判斷擴增系統的可信性。
以上就是PCR實驗室的污染來源及防污染措施。更多實驗室相關產品信息,敬請關注河南中潤實驗工程公司官網,產品咨詢及實驗室EPC設計建設請聯系網站客服。